Nature：新冠患者转为重症的预警生物体被发现

COVID-19病者的表现可以从无症状携带、轻症到需要呼吸机甚至体外膜肺氧合（ECMO）维持生命的危急诊病变，这其中所的决定性决定性因素几乎全面性密码。同时，新型冠状大肠杆菌是否在传递过程中所再次发生突出的变异，导致大肠杆菌毒力和传染性的改变，也亟需促使数据分析。

自疫情爆发之后，复旦大学原为上海市公共医疗卫生外科的中所心（下述简称公卫的中所心）与再生中医国际组织多各个方面科技基础基础设施（上海）（下述简称基础设施）、上海血液学数据分析所、中医DNA学国际组织要点数据分析室、瑞金医院外科大肠杆菌学数据分析室，复旦大学上海中医院分子大肠杆菌数据分析室、上海交通大学中医院原为同仁医院、中所科院植物表征生态数据分析所、上海巴斯德数据分析所和上海糖类与健康数据分析所等单位合力，就新型冠状大肠杆菌DNA、分子流行病学在结构上、病因外科特征进行了深入数据分析。

5翌年20日，《Nature》时尚杂志发表了这一工作团队的不断更新数据分析结果。具体来说，公医疗卫生的中所心卢洪洲教授与基础设施主任陈赛娟院士曾两次的联合攻关工作团队，收集了公卫的中所心在2020年1翌年20日-2翌年25日期间收治的326则有病变标本，对大肠杆菌DNA变异、外科表现在结构上和免疫反应改变等数据进行了全面深达统计分析。

数据分析工作团队借助于技术方法，高质量进行了112则有新冠大肠杆菌DNA分子生物学、零件和判别。他们基于大肠杆菌DNA数列的进化树统计分析挖掘出，新冠大肠杆菌主要有两个分支（Clade I 和Clade II）。已确认有华南海鲜商品碰触史的6则有病变均集中所在其中所一个叶为中所（Clade I），而Clade II病变无该碰触史，提示COVID-19疫情的再次发生并不局限于华南海鲜商品。

新冠大肠杆菌DNA进化树

接着，通过对疫情暴发的不同时间阶段性和不同区域病变的新冠大肠杆菌基因数列（截至2020年3翌年初）变异特征的比较统计分析，从上海个案分离的大肠杆菌DNA中所识别了169个核苷酸改变，其重复再次出现的突变与已公布的大肠杆菌数列一致，呈现较为安定的进化过程，提示该大肠杆菌可能在疫情晚期就已适应在人类宿主中所传递。同时他们挖掘出， 新冠大肠杆菌两个分支的传递性、免疫力和外科表现等各个方面无突出差异，未曾挖掘出与COVID-19急诊病变有突出系统性的大肠杆菌变异数列。

COVID-19病者免疫细胞变动

数据分析其他部门从外科和神经生物学数据分析挖掘出，COVID-19病变免疫细胞突出减缓，相比较是急诊病变CD4+和CD8+ T细胞呈突出进行性下降趋势，且炎性特异性IL-6和IL-8突出抬高。COVID-19病因转型严重程度的决定因素主要与病变年龄组、基础病因及免疫细胞减缓和系统性的特异性天气系统密切系统性，为病因向急诊转变的决定性克劳德特因子。

这一数据分析结果意义深远，对于促使认清新型冠状大肠杆菌的分子流行病特征、病因再次发生转型连续性，为急诊病者晚期确诊和治疗法，以及为用药和疫苗研发提供了重要的参考依据。

此外，数据分析工作团队还向中所国国际组织组学数据百科全书（The National Omics Data Encyclopedia，NODE） ()、全世界流感数列数据库(GISAID)和NCBI的全世界性数列数据库（SRA）签字了112个个案的新冠大肠杆菌DNA高质量数列数据。同时，基础设施也摆设了多各个方面病因大数据平台新冠大肠杆菌DNA数据交互式、开源在线统计分析网站（）。海内外科研单位和科学家都可仅仅共享系统性数据分析数据。

原始原文：

Xiaonan Zhang, Yun Tan, Yun Ling, et.al. Viral and host factors related to the clinical outcome of COVID-19. Nature 20 May 2020